Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms