Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK5Q6P3R8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms