Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEPROQ6NW34 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms