Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFSP1Q6NVU6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms