Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCTN3Q6NUS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCTN3Q6NUS6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCTN3Q6NUS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms