Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RCSD1Q6JBY9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms