Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL2Q6F5E8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms