Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
REP15Q6BDI9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REP15Q6BDI9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REP15Q6BDI9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms