Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPECC1LQ69YQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPECC1LQ69YQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms