Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3L3Q68CJ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms