Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1BQ659C4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms