Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms