Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND4CQ5VZ89 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND4CQ5VZ89 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND4CQ5VZ89 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND4CQ5VZ89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND4CQ5VZ89 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND4CQ5VZ89 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND4CQ5VZ89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND4CQ5VZ89 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms