Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms