Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1A1P5Q5VTE0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms