Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RPRD2Q5VT52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RPRD2Q5VT52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms