Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms