Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM78Q5T7P6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM78Q5T7P6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms