Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F0

DCAF12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF12Q5T6F0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF12Q5T6F0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF12Q5T6F0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms