Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms