Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMPD1Q5SYB0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms