Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC38Q5R3I4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC38Q5R3I4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC38Q5R3I4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms