Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCID2Q5JVF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms