Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms