Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIA3Q5JRA6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIA3Q5JRA6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 660.6 ms