Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYL7

TMEM196, Transmembrane protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM196Q5HYL7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM196Q5HYL7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM196Q5HYL7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms