Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms