Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms