Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms