Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms