Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC38Q502W7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC38Q502W7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms