Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms