Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms