Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF212Q495C1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms