Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms