Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G4EQ3MJ16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms