Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms