Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL40Q2TBA0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms