Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VWC2Q2TAL6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms