Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TYSND1Q2T9J0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms