Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms