Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms