Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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