Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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