Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOXD1Q16676 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FOXD1Q16676 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
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