Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIL3Q16649 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
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