Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NREPQ16612 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NREPQ16612 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NREPQ16612 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NREPQ16612 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NREPQ16612 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NREPQ16612 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NREPQ16612 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NREPQ16612 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NREPQ16612 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NREPQ16612 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms