Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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TAF9Q16594 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF9Q16594 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF9Q16594 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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