Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms