Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NTRK3Q16288 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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